Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

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Length 779 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hcn3O88705 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hcn3O88705 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hcn3O88705 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hcn3O88705 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hcn3O88705 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hcn3O88705 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Hcn3O88705 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn3O88705 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hcn3O88705 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hcn3O88705 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn3O88705 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn3O88705 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hcn3O88705 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hcn3O88705 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Hcn3O88705 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn3O88705 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn3O88705 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn3O88705 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Hcn3O88705 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Hcn3O88705 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn3O88705 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hcn3O88705 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Hcn3O88705 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hcn3O88705 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Hcn3O88705 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hcn3O88705 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Hcn3O88705 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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