Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ebi3O35228 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ebi3O35228 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ebi3O35228 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ebi3O35228 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ebi3O35228 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ebi3O35228 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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