Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn4O35054 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms