Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PbsnO08976 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PbsnO08976 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PbsnO08976 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PbsnO08976 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PbsnO08976 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PbsnO08976 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PbsnO08976 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PbsnO08976 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PbsnO08976 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PbsnO08976 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PbsnO08976 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms