Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm379J3QQ19 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm379J3QQ19 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm379J3QQ19 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm379J3QQ19 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm379J3QQ19 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm379J3QQ19 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm379J3QQ19 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Gm379J3QQ19 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Gm379J3QQ19 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm379J3QQ19 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm379J3QQ19 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm379J3QQ19 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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