Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm21818J3KMS6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Gm21818J3KMS6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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