Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim55G3X8Y1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms