Protein–RNA interactions for Protein: F6YHC1

Gm6482, Predicted gene 6482 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6482F6YHC1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6482F6YHC1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm6482F6YHC1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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