Protein–RNA interactions for Protein: F6XJP7

Pcsk6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, mousemouse

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Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk6F6XJP7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pcsk6F6XJP7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pcsk6F6XJP7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Pcsk6F6XJP7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pcsk6F6XJP7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pcsk6F6XJP7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pcsk6F6XJP7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pcsk6F6XJP7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pcsk6F6XJP7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pcsk6F6XJP7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pcsk6F6XJP7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pcsk6F6XJP7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Pcsk6F6XJP7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pcsk6F6XJP7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms