Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lmod3E9QA62 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms