Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cald1E9QA15 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cald1E9QA15 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms