Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syde2E9PUP1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syde2E9PUP1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms