Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scn3aA2ASI5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms