Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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