Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptgdr2Q9Z2J6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms