Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn6Q9Z262 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn6Q9Z262 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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