Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nme3Q9WV85 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme3Q9WV85 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms