Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB0

Rbck1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbck1Q9WUB0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbck1Q9WUB0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms