Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt71Q9R0H5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt71Q9R0H5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms