Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nek3Q9R0A5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nek3Q9R0A5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms