Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cbx8Q9QXV1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms