Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pcsk1nQ9QXV0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms