Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354bQ9QXT9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms