Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cdkl2Q9QUK0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms