Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Csnk1eQ9JMK2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms