Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms