Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms