Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clstn2Q9ER65 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms