Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stx12Q9ER00 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms