Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms