Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn34b2Q9D9N2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn34b2Q9D9N2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn34b2Q9D9N2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b2Q9D9N2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms