Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q9D8L0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms