Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fip1l1Q9D824 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms