Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms