Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms