Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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