Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SarnpQ9D1J3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms