Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nde1Q9CZA6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms