Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RpainQ9CWY9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms