Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pfdn1Q9CWM4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pfdn1Q9CWM4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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