Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms