Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms