Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SncaipQ99ME3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncaipQ99ME3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms