Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Prpf19Q99KP6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Prpf19Q99KP6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Prpf19Q99KP6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf19Q99KP6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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