Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Reep3Q99KK1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Reep3Q99KK1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms