Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CsprsQ99388 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms