Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TardbpQ921F2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TardbpQ921F2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms