Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccdc71Q8VEG0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc71Q8VEG0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc71Q8VEG0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc71Q8VEG0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccdc71Q8VEG0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71Q8VEG0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71Q8VEG0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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