Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ttc39cQ8VE09 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc39cQ8VE09 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms