Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trappc12Q8K2L8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc12Q8K2L8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms